Nocardioformas frente a organismos similares a Nocardia

por la microscopista de Aquafix, Natalie Walton.

Nos gusta estar al día de lo que ocurre en la microbiología de las aguas residuales. Durante uno de nuestros proyectos de investigación, descubrimos que "Nocardioformas" es un término anticuado. Cuando se desarrolló la clasificación de las Nocardioformas, la tecnología no estaba lo suficientemente avanzada como para comprender la verdadera diversidad de filamentos que entrarían en esta clasificación. Sin embargo, ahora sí la conocemos. Este árbol filogenético muestra lo amplio que es el término Nocardioformes.
Gordoniaceae y Nocardaceae son las familias de filamentos más comunes con verdadera ramificación observada en aguas residuales. Sin embargo, no pueden diferenciarse únicamente mediante microscopía óptica, por lo que a menudo se utilizan indistintamente. Estas familias sólo pueden distinguirse mediante la secuenciación del ARNr 16, que no es una práctica habitual en la identificación de filamentos en aguas residuales. La secuenciación no es una práctica común para diferenciar estos filamentos, ya que tienen una similitud del 89% al 98% en el ADN, prosperan en condiciones similares y causan los mismos problemas. Por lo tanto, estos filamentos pueden tratarse de la misma manera, lo que hace innecesaria la secuenciación en la identificación básica de aguas residuales. Así pues, estos filamentos se denominan ahora organismos similares a Nocardia o NALO como término genérico.
Es importante referirse a estos filamentos como NALO en lugar de Nocardioformes, ya que NALO sólo incluye los géneros con verdadera ramificación. Distinguir esta característica es importante ya que la ramificación verdadera es específica de NALO, ningún otro filamento de aguas residuales comúnmente observado la tiene. Por lo tanto, la ramificación verdadera se utiliza como una de las características clave en la identificación de NALO.
Árbol filogenético de organismos similares a Nocardia